Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
4930567H17RikQ3V0K5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms