Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf6Q3TWW8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Srsf6Q3TWW8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms