Protein–RNA interactions for Protein: Q2PZL6

Fat4, Protocadherin Fat 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fat4Q2PZL6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fat4Q2PZL6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fat4Q2PZL6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fat4Q2PZL6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fat4Q2PZL6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fat4Q2PZL6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fat4Q2PZL6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fat4Q2PZL6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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