Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mex3cQ05A36 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mex3cQ05A36 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mex3cQ05A36 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mex3cQ05A36 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mex3cQ05A36 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mex3cQ05A36 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mex3cQ05A36 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms