Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ly6dP35459 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms