Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rom1P32958 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rom1P32958 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rom1P32958 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rom1P32958 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rom1P32958 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rom1P32958 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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