Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01793 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01793 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01793 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01793 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01793 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01793 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01793 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01793 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01793 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01793 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01793 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01793 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01793 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01793 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01793 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01793 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01793 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01793 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01793 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01793 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01793 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01793 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01793 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01793 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01793 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01793 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01793 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01793 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01793 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01793 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01793 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01793 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01793 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01793 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01793 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01793 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01793 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01793 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01793 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01793 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01793 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01793 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01793 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01793 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01793 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01793 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01793 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01793 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01793 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01793 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01793 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01793 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01793 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P01793 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01793 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01793 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01793 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01793 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01793 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01793 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01793 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01793 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01793 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01793 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01793 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01793 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01793 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms