Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdkO55028 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdkO55028 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdkO55028 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdkO55028 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BckdkO55028 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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BckdkO55028 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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BckdkO55028 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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BckdkO55028 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BckdkO55028 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BckdkO55028 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BckdkO55028 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BckdkO55028 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BckdkO55028 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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