Protein–RNA interactions for Protein: E9PVR6

Vmn1r1, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r1E9PVR6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r1E9PVR6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms