Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4491E0CX42 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4491E0CX42 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4491E0CX42 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4491E0CX42 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4491E0CX42 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4491E0CX42 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4491E0CX42 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4491E0CX42 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm4491E0CX42 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm4491E0CX42 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm4491E0CX42 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm4491E0CX42 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm4491E0CX42 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm4491E0CX42 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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