Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dclk1Q9JLM8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk1Q9JLM8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms