Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc22Q9JIG7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms