Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap5s1Q9D742 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms