Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrtapQ9CYD3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrtapQ9CYD3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrtapQ9CYD3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrtapQ9CYD3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrtapQ9CYD3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrtapQ9CYD3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrtapQ9CYD3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrtapQ9CYD3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrtapQ9CYD3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrtapQ9CYD3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrtapQ9CYD3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrtapQ9CYD3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrtapQ9CYD3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrtapQ9CYD3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CrtapQ9CYD3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CrtapQ9CYD3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms