Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TirapQ99JY1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TirapQ99JY1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms