Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp9Q91WM3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms