Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN2

Atp1a1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a1Q8VDN2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1a1Q8VDN2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a1Q8VDN2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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