Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh2d5Q8JZW5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms