Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG51

Rhot1, Mitochondrial Rho GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhot1Q8BG51 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhot1Q8BG51 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rhot1Q8BG51 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rhot1Q8BG51 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhot1Q8BG51 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhot1Q8BG51 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhot1Q8BG51 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhot1Q8BG51 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhot1Q8BG51 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhot1Q8BG51 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhot1Q8BG51 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhot1Q8BG51 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhot1Q8BG51 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhot1Q8BG51 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms