Protein–RNA interactions for Protein: Q80WG5

Lrrc8a, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8aQ80WG5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc8aQ80WG5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc8aQ80WG5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms