Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl4Q3URY0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms