Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CgnP59242 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CgnP59242 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CgnP59242 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CgnP59242 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CgnP59242 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CgnP59242 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CgnP59242 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CgnP59242 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CgnP59242 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CgnP59242 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CgnP59242 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CgnP59242 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CgnP59242 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CgnP59242 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CgnP59242 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CgnP59242 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CgnP59242 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CgnP59242 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CgnP59242 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CgnP59242 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CgnP59242 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CgnP59242 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CgnP59242 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CgnP59242 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CgnP59242 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CgnP59242 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CgnP59242 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CgnP59242 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CgnP59242 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CgnP59242 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CgnP59242 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CgnP59242 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CgnP59242 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CgnP59242 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CgnP59242 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CgnP59242 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CgnP59242 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CgnP59242 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CgnP59242 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CgnP59242 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CgnP59242 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CgnP59242 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CgnP59242 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CgnP59242 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CgnP59242 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CgnP59242 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CgnP59242 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CgnP59242 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CgnP59242 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CgnP59242 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CgnP59242 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CgnP59242 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CgnP59242 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CgnP59242 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CgnP59242 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CgnP59242 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CgnP59242 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CgnP59242 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CgnP59242 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CgnP59242 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CgnP59242 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CgnP59242 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CgnP59242 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CgnP59242 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CgnP59242 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CgnP59242 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CgnP59242 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CgnP59242 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CgnP59242 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CgnP59242 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CgnP59242 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CgnP59242 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CgnP59242 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CgnP59242 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CgnP59242 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CgnP59242 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CgnP59242 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CgnP59242 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CgnP59242 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CgnP59242 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CgnP59242 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CgnP59242 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CgnP59242 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CgnP59242 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CgnP59242 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CgnP59242 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CgnP59242 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CgnP59242 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CgnP59242 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CgnP59242 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CgnP59242 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CgnP59242 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CgnP59242 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CgnP59242 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CgnP59242 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CgnP59242 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CgnP59242 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CgnP59242 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CgnP59242 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.2 ms