Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JtbO88824 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JtbO88824 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JtbO88824 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JtbO88824 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JtbO88824 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JtbO88824 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JtbO88824 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
JtbO88824 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JtbO88824 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JtbO88824 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JtbO88824 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
JtbO88824 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JtbO88824 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JtbO88824 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JtbO88824 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JtbO88824 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JtbO88824 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JtbO88824 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JtbO88824 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JtbO88824 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JtbO88824 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JtbO88824 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JtbO88824 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JtbO88824 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JtbO88824 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JtbO88824 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
JtbO88824 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JtbO88824 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JtbO88824 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JtbO88824 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JtbO88824 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JtbO88824 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JtbO88824 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JtbO88824 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JtbO88824 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JtbO88824 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JtbO88824 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JtbO88824 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JtbO88824 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JtbO88824 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JtbO88824 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JtbO88824 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JtbO88824 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JtbO88824 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JtbO88824 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JtbO88824 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
JtbO88824 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JtbO88824 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JtbO88824 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JtbO88824 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JtbO88824 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JtbO88824 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JtbO88824 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JtbO88824 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JtbO88824 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JtbO88824 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JtbO88824 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JtbO88824 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JtbO88824 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JtbO88824 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JtbO88824 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JtbO88824 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JtbO88824 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JtbO88824 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JtbO88824 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JtbO88824 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JtbO88824 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JtbO88824 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JtbO88824 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JtbO88824 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JtbO88824 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
JtbO88824 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JtbO88824 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
JtbO88824 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JtbO88824 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JtbO88824 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JtbO88824 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JtbO88824 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JtbO88824 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JtbO88824 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JtbO88824 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JtbO88824 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JtbO88824 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JtbO88824 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JtbO88824 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JtbO88824 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JtbO88824 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JtbO88824 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
JtbO88824 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
JtbO88824 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JtbO88824 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JtbO88824 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JtbO88824 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JtbO88824 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JtbO88824 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JtbO88824 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JtbO88824 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JtbO88824 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JtbO88824 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 275 ms