Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pja1O55176 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pja1O55176 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja1O55176 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja1O55176 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pja1O55176 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms