Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930444P10RikD3YUR1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444P10RikD3YUR1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.2 ms