Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Scn7aB1AYL1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Scn7aB1AYL1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 223.4 ms