Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM5

Yipf7, Protein YIPF7, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf7Q9JIM5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yipf7Q9JIM5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf7Q9JIM5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms