Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd2Q9D8U0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms