Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lsm12Q9D0R8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms