Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrto4Q9D0I8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrto4Q9D0I8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms