Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr3eQ9CZT4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr3eQ9CZT4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Polr3eQ9CZT4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr3eQ9CZT4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr3eQ9CZT4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms