Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc96Q9CR92 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms