Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc43Q9CR29 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc43Q9CR29 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms