Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sbno2Q7TNB8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms