Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Szrd1Q6NXN1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Szrd1Q6NXN1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Szrd1Q6NXN1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms