Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ndufa4Q62425 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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