Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkaa1Q5EG47 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms