Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syndig1lQ3USQ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1lQ3USQ7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syndig1lQ3USQ7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms