Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srebf2Q3U1N2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms