Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cct5P80316 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cct5P80316 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cct5P80316 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cct5P80316 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cct5P80316 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cct5P80316 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cct5P80316 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cct5P80316 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cct5P80316 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cct5P80316 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cct5P80316 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cct5P80316 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct5P80316 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct5P80316 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cct5P80316 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct5P80316 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct5P80316 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct5P80316 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cct5P80316 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct5P80316 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms