Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc4P51655 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc4P51655 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpc4P51655 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms