Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd8P23463 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd8P23463 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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