Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spi1P17433 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spi1P17433 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spi1P17433 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spi1P17433 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Spi1P17433 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spi1P17433 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spi1P17433 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spi1P17433 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spi1P17433 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spi1P17433 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spi1P17433 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spi1P17433 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms