Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01662 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01662 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01662 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01662 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01662 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01662 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01662 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01662 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01662 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01662 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01662 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01662 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01662 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01662 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01662 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01662 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01662 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01662 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
P01662 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01662 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01662 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01662 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01662 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01662 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01662 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01662 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01662 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01662 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01662 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01662 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01662 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01662 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01662 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01662 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01662 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01662 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01662 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01662 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01662 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01662 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01662 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01662 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01662 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01662 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01662 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01662 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01662 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01662 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01662 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01662 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01662 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01662 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01662 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01662 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01662 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01662 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01662 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01662 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01662 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01662 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01662 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01662 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01662 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01662 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01662 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01662 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01662 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01662 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01662 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01662 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01662 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01662 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01662 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01662 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01662 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01662 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01662 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01662 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01662 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01662 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01662 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01662 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01662 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01662 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms