Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa3bJ9JI28 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vwa3bJ9JI28 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms