Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms