Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms