Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plcb2A3KGF7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plcb2A3KGF7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms