Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited4Q9WUL8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms