Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem239Q9DA47 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms